“Data exchange” service offers individual users metadata transfer in several different formats. Citation formats are offered for transfers in texts as for the transfer into internet pages. Citation formats include permanent links that guarantee access to cited sources. For use are commonly structured metadata schemes : Dublin Core xml and ETUB-MS xml, local adaptation of international ETD-MS scheme intended for use in academic documents.
Export
Umičević Šipka, Sanja
Povezanost diverziteta mikrobioma digestivnog trakta
i genotipova kožnih izolata Staphylococcus aureus sa atopijskim dermatitisom djece
Autorstvo-Nekomercijalno-Deliti pod istim uslovima 3.0 (CC BY-NC-SA 3.0)
Dozvoljavate umnožavanje, distribuciju i javno saopštavanje dela, i prerade, ako se navede ime autora na način odredjen od strane autora ili davaoca licence i ako se prerada distribuira pod istom ili sličnom licencom. Ova licenca ne dozvoljava komercijalnu upotrebu dela i prerada. Osnovni opis Licence: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/rs/deed.sr_LATN Sadržaj ugovora u celini: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/rs/legalcode.sr-Latn
Academic metadata
Doktorska disertacija
Medicinske nauke
Univerzitet u Banjoj Luci
Medicinski fakultet
Other Theses Metadata
The correlation of the gut microbiome diversity
and genotypes of Staphylococcus aureus skin isolates with atopic dermatitis in children
Atopijski dermatitis (AD) predstavlja jednu od najčešćih, hroničnih upalnih
upalnih bolesti kože kod dojenčadi i djece koji se manifestuje suvom kožom i svrabom kao osnovnim simptomom bolesti. Zbog oštećenja površinskog sloja kožnog omotača dolazi do olakšane adherencije i česte kolonizacije bakterije Staphylococcus aureus, koja pogoršava upalni proces i utiče na težinu kliničke slike. Osim kolonizacije bakterija, na težinu kliničke slike i tok bolesti značajno utiču i mikroorganizmi na površini kože, kao i u crijevima,
označeni zajedničkim nazivom humani mikrobiom. Cilj istraživanja bio je da se analiziramo sastav crijevnog mikrobioma i ispita kolonizacija S. aureus izolata kod djece sa AD i njihovih direktnih srodnika (braća, sestre), te dokaže povezanost sastava crijevnog mikrobioma i genotipova S. aureus sa AD.
U istraživanju je učestvovalo je 60 ispitanika, pedijatrijske populacije, uzrasta od 3-18 godina, od kojih je 30 djece činilo eksperimentalnu grupu sa srednje teškom i teškom kliničkom slikom AD, a kontrolnu grupu su činili njihovi zdravi srodnici bez AD ili bilo kojeg drugog oboljenja iz atopijskog marša. Sastav crijevnog mikrobioma je određen metagenomskim analizama tzv. "shot-gun" sekvenciranja V3-V6 16S RNK, a S. aureus izolatima je rađeno sekvenciranje čitavog genoma i testirana je sposobnost produkcije biofilma. Takođe, pacijentima su urađene i hematološke (KKS) i imunološke analize (IL4, ukupni IgE i specifični IgE na nutritivne i inhalatorne alergene).
Kao najznačajniji rezultat ustanovljeno je da ne postoji razlika u diverzitetu crijevnog mikrobioma oboljele djece i njihovih zdravih srodnika. Jedina razlika je ustanovljena kod nedominantne bakterije iz roda Tyzzarella koja je bila statistički značajno učestalija kod oboljelih ispitanika, za razliku od Lachnospiraceum GAM i Lachnospiraceum NK316A, koje su značajno češće detektovane kod zdravih ispitanika. Takođe, ustanovili smo da je S. aureus
genotip ST7 bio dominantan kod djece sa teškom kliničkom slikom, dok nismo dokazali razliku između grupa u detekciji gena faktora virulencije bakterija izolovanih kod oboljelih i zdravih ispitanika. Uočili smo statistički značajnu razliku u vrijednostima IL-4, ukupnog IgE i specifičnog IgE za mješavinu 6 trava koji su bili značajno veći kod oboljele djece nego kod zdravih srodnika. U budućnosti bi trebalo dodatno ispitati međusobne interakcije
bakterija u sastavu mikrobioma i eventualnu razliku u stvaranju produkata metabolizma (metabolom) da bi eventualno tako objasnili uticaj mikroorganizama na nastanak AD.
Atopic dermatitis (AD) is one of the most common chronic inflammatory skin diseases in infants and children, characterized by dry skin and pruritus as primary symptoms. Due to the disruption of the skin barrier, there is increased adherence and frequent colonization by Staphylococcus aureus, which exacerbates the inflammatory process and influences the severity of the clinical presentation. In addition to bacterial colonization, the severity and course of the disease are significantly affected by microorganisms present on the skin and in the gut, collectively referred to as the human microbiome. The aim of our study was to analyze the composition of the gut microbiome and investigate the colonization
of S. aureus isolates in children with AD and their direct relatives (siblings) to establish a correlation between gut microbiome composition and S. aureus genotypes in relation to AD.
In our study, 60 pediatric participants aged 3 to 18 years were included. The
experimental group consisted of 30 children with moderate to severe AD, while the control group comprised their healthy siblings without AD or any other atopic march-related disease.
The composition of the gut microbiome was determined using metagenomic shotgun
sequencing of the V3–V6 regions of 16S rRNA. Whole-genome sequencing was performed
on S. aureus isolates, and their biofilm production capacity was assessed. Additionally, hematological (complete blood count) and immunological analyses (IL-4, total IgE, and specific IgE for food and inhalant allergens) were conducted.
The most significant finding of our study was that there is no difference in gut
microbiome diversity between affected children and their healthy siblings. The only observed difference was in the prevalence of non-dominant bacterial species, with Tyzzarella being significantly more frequent in affected individuals, whereas Lachnospiraceum GAM and Lachnospiraceum NK316A were more commonly detected in healthy participants.
Furthermore, we found that the S. aureus genotype ST7 was dominant in children with severe AD, however, no difference was observed between groups regarding the detection of virulence factor genes in bacterial isolates from affected and healthy participants. A statistically significant difference was noted in IL-4 levels, total IgE, and specific IgE for a mixture of six grasses, which were significantly elevated in children with AD compared to their healthy siblings.
Future research should further explore bacterial interactions within the microbiome and potential differences in the production of metabolic products (metabolome) to better understand the role of microorganisms in the pathogenesis of AD.
atopic dermatitis, gut microbiome, Staphylococcus aureus, virulence factors, biofilm
prema CERIF šifrarniku : B590
Serbian
Atopijski dermatitis (AD) predstavlja jednu od najčešćih, hroničnih upalnih
upalnih bolesti kože kod dojenčadi i djece koji se manifestuje suvom kožom i svrabom kao osnovnim simptomom bolesti. Zbog oštećenja površinskog sloja kožnog omotača dolazi do olakšane adherencije i česte kolonizacije bakterije Staphylococcus aureus, koja pogoršava upalni proces i utiče na težinu kliničke slike. Osim kolonizacije bakterija, na težinu kliničke slike i tok bolesti značajno utiču i mikroorganizmi na površini kože, kao i u crijevima,
označeni zajedničkim nazivom humani mikrobiom. Cilj istraživanja bio je da se analiziramo sastav crijevnog mikrobioma i ispita kolonizacija S. aureus izolata kod djece sa AD i njihovih direktnih srodnika (braća, sestre), te dokaže povezanost sastava crijevnog mikrobioma i genotipova S. aureus sa AD.
U istraživanju je učestvovalo je 60 ispitanika, pedijatrijske populacije, uzrasta od 3-18 godina, od kojih je 30 djece činilo eksperimentalnu grupu sa srednje teškom i teškom kliničkom slikom AD, a kontrolnu grupu su činili njihovi zdravi srodnici bez AD ili bilo kojeg drugog oboljenja iz atopijskog marša. Sastav crijevnog mikrobioma je određen metagenomskim analizama tzv. "shot-gun" sekvenciranja V3-V6 16S RNK, a S. aureus izolatima je rađeno sekvenciranje čitavog genoma i testirana je sposobnost produkcije biofilma. Takođe, pacijentima su urađene i hematološke (KKS) i imunološke analize (IL4, ukupni IgE i specifični IgE na nutritivne i inhalatorne alergene).
Kao najznačajniji rezultat ustanovljeno je da ne postoji razlika u diverzitetu crijevnog mikrobioma oboljele djece i njihovih zdravih srodnika. Jedina razlika je ustanovljena kod nedominantne bakterije iz roda Tyzzarella koja je bila statistički značajno učestalija kod oboljelih ispitanika, za razliku od Lachnospiraceum GAM i Lachnospiraceum NK316A, koje su značajno češće detektovane kod zdravih ispitanika. Takođe, ustanovili smo da je S. aureus
genotip ST7 bio dominantan kod djece sa teškom kliničkom slikom, dok nismo dokazali razliku između grupa u detekciji gena faktora virulencije bakterija izolovanih kod oboljelih i zdravih ispitanika. Uočili smo statistički značajnu razliku u vrijednostima IL-4, ukupnog IgE i specifičnog IgE za mješavinu 6 trava koji su bili značajno veći kod oboljele djece nego kod zdravih srodnika. U budućnosti bi trebalo dodatno ispitati međusobne interakcije
bakterija u sastavu mikrobioma i eventualnu razliku u stvaranju produkata metabolizma (metabolom) da bi eventualno tako objasnili uticaj mikroorganizama na nastanak AD.
https://phaidra.unibl.org/detail_object/o:3608
