“Data exchange” service offers individual users metadata transfer in several different formats. Citation formats are offered for transfers in texts as for the transfer into internet pages. Citation formats include permanent links that guarantee access to cited sources. For use are commonly structured metadata schemes : Dublin Core xml and ETUB-MS xml, local adaptation of international ETD-MS scheme intended for use in academic documents.
Dozvoljavate umnožavanje, distribuciju i javno saopštavanje dela, i prerade, ako se navede ime autora na način odredjen od strane autora ili davaoca licence. Ova licenca ne dozvoljava komercijalnu upotrebu dela. Osnovni opis Licence: http://creativecommons.org/licenses/by-nc/3.0/rs/deed.sr_LATN Sadržaj ugovora u celini: http://creativecommons.org/licenses/by-nc/3.0/rs/legalcode.sr-Latn
Academic metadata
Doktorska disertacija
Biotehnološke nauke
Univerzitet u Banjoj Luci
Poljoprivredni fakultet
Katedra za ratarstvo i poljoprivrednu mehanizaciju
Other Theses Metadata
Bacteria as pathogens of small grain cereals in Serbia
Научна област – Пољопривредне науке Научно поље – Пољопривредне биљне науке, Заштита здравља биљака и агроекологија/Scientific area – Agricultural sciences
Scientific field – Agricultural plant sciences, Plant Protection and Agroecology
Обрадовић, Алекса (mentor)
Тркуља, Војислав (predsednik komisije)
Јевтић, Радивоје (član komisije)
Узорци зараженог биљног материјала стрних жита са симптомима налик онима које проузрокују бактерије прикупљени су у периоду 2009 – 2014. године, а потом
је извршена и изолација и идентификација изолованих сојева применом класичних
метода проучавања патогених и биохемијско-физиолошких одлика бактерија, али и
новијих молекуларних метода анализе ДНК, чиме је по први пут детаљније окарактерисана популација ових патогена у Србији. Од 55 проучаваних сојева, 15 сојева је идентификовано као P. s. pv. atrofaciens и класификовано у филогрупу 2b. Ово је први налаз овог патогена у Србији и то на пшеници, јечму, овсу, ражи, тритикалеу и кукурузу. Шест сојева изолованих са пшенице, јечма, овса, ражи и тритикалеа, идентификовани су као P. s. pv. lapsa/aptata и класификовани у филогрупу 2b, што је такође први налаз ових патовара на стрним житима у Србији и један од ретких у свету. Осам сојева је идентификовано као P. viridiflava и класификовано у филогрупу 7а, док је сој 27тк класификован у филогрупу 8. Према сазнањима докторанта, ово је први налаз P. viridiflava у свету на стрним житима
уопште и то на овсу, ражи и тритикалеу. Одређени број сојева блиско сродан (99%) са патоварима из филогрупе 2b (P. s. pv.syringae/aptata/atrofaciens/lapsa/japonicа), проузрокује симптоме на јечму, овсу,тритикалеу, дуруму и кукурузу. Од сојева класификованих у филогрупу 2d, један блиско сродан P. s. pv. coryli је патоген овса, а други блиско сродан P. s. pv. aceris/solidagae проузрокује симптоме на доњем делу стабла пшенице. Према сазнањима докторанта, ни ови патовари нису до сада идентификовани као патогени стрних жита у свету. Три соја блиско сродна P. s. pv. coronafaciens/oryzae, и девет сојева блиско сродних P.s. pv. porri/striafaciens проузрокују симптоме на овсу и ражи и класификовани су у филогрупу 4. Ово је први налаз патовара из филогрупе 4 на ражи у Србији, док су на овсу такође први пут у Србији пронађени и патовари P. s. pv. porri и P. s. pv. striafaciens.На основу резултата ових истраживања, познати диверзитет бактерија као патогена стрних жита се проширује на нове патоваре у оквиру P. syringae sensu stricto или збирне врсте P. syringae и на нову врсту (P. viridiflava) у оквиру P. syringae sensu lato или P. syringae комплекс врста.Међу примењеним методама, осим филогенетске анализе, као поуздан критеријум за диференцијацију бактерија патогена стрних жита може се користити само стварање сирингомицина и то у карактеризацији сојева из филогрупе 2b. Постојање фазнe варијацијe фенотипа доводи у питање коришћење LOPAT шеме као традиционалног дијагностичког средства за диференцијацију P. viridiflava до нивоа врсте.Бактериозе стрних жита у Србији су резултат интеракције више различитих врста/популација бактерија P. syringae sensu stricto и P. syringae sensu lato, из чега проистиче потреба за дефинисањем и новог Коховог постулата који то узима у обзир
Samples od infected plant material of small grain cereals with symptoms similar
to those caused by bacteria were collected in the period 2009-2014, followed by isolation and identification of isolated strains obtained using conventional methods of studying pathogenic and biochemical-physiological characteristics of bacteria, including newer molecular methods of DNA analyses, which for the first time characterized the population of these pathogens in Serbia in more detail.
Among 55 studied strains, 15 strains are identified as P. s. pv. atrofaciens and classified in phylogroup 2b. This is the first report of this pathogen in Serbia and that on wheat, barley, oat, rye, triticale and corn. Six strains isolated from wheat, barley, rye and triticale are identified as P. s. pv. lapsa/aptata and classified in phylogroup 2b, which is also the first report of these pathovars on small grain cereals in Serbia and rare one in the world. Eight strains are identified as P. viridiflava and classified in phylogroup 7a, while strain 27tk is classified in phylogroup 8. According to available data, this is the first report of P. viridiflava on small grain cereals in the world at all and that on oat, rye and triticale.Certain number of strains highly similar (99%) to pathovars in phylogroup 2b (P. s. pv.syringae/aptata/atrofaciens/lapsa/japonicа) cause symptoms on barley, oat, triticale, durum and corn. Among strains classified in phylogroup 2d, one highly similar to P. s. pv. coryli is pathogen of oat and another highly similar to P. s. pv. aceris/solidagae causes symptoms on lower part of wheat stem. According to available data neither one of these pathovars has been identified as small grain cereals pathogens in the world. Three strains highly similar to P. s. pv. coronafaciens/oryzae and nine strains highly similar to P. s. pv. porri/striafaciens cause symptoms on oat and rye and are classified in phylogroup
4. This is the first report of pathovars in phylogroup 4 on rye in Serbia, while pathovars P. s.pv. porri и P. s. pv. striafaciens are identified for the first time on oat in Serbia, as well. Based on results of this research, known diversity of bacteria as pathogens of small grain cereals is now extended to new pathovars within P. syringae sensu stricto or P. syringae complex and also extended to new species (P. viridiflava) within P. syringae sensu lato or P. syringae species complex.Among methods used, beside phylogenetic analyses, only production of syringomycin can be used as reliable criteria for characterization of bacteria as pathogens of small grain cereals, but only for characterization of strains within phylogroup 2b. Existance of phase variation of phenotype calls into question use of LOPAT scheme as traditional diagnostic tool for differentiation of P. viridiflava to species level. Small grain cereals bacterial diseases in Serbia
are result of interaction of different species/populations of bacteria within P. syringae sensu stricto and P. syringae sensu lato hence the need to define new Koch`s postulate that takes thisinto account.
Према CERIF шифрарнику –
8000 Биомедицинске науке; 8390 Фитотехника, хортикултура, заштита приноса,
фитопатологија
Serbian
Узорци зараженог биљног материјала стрних жита са симптомима налик онима које проузрокују бактерије прикупљени су у периоду 2009 – 2014. године, а потом
је извршена и изолација и идентификација изолованих сојева применом класичних
метода проучавања патогених и биохемијско-физиолошких одлика бактерија, али и
новијих молекуларних метода анализе ДНК, чиме је по први пут детаљније окарактерисана популација ових патогена у Србији. Од 55 проучаваних сојева, 15 сојева је идентификовано као P. s. pv. atrofaciens и класификовано у филогрупу 2b. Ово је први налаз овог патогена у Србији и то на пшеници, јечму, овсу, ражи, тритикалеу и кукурузу. Шест сојева изолованих са пшенице, јечма, овса, ражи и тритикалеа, идентификовани су као P. s. pv. lapsa/aptata и класификовани у филогрупу 2b, што је такође први налаз ових патовара на стрним житима у Србији и један од ретких у свету. Осам сојева је идентификовано као P. viridiflava и класификовано у филогрупу 7а, док је сој 27тк класификован у филогрупу 8. Према сазнањима докторанта, ово је први налаз P. viridiflava у свету на стрним житима
уопште и то на овсу, ражи и тритикалеу. Одређени број сојева блиско сродан (99%) са патоварима из филогрупе 2b (P. s. pv.syringae/aptata/atrofaciens/lapsa/japonicа), проузрокује симптоме на јечму, овсу,тритикалеу, дуруму и кукурузу. Од сојева класификованих у филогрупу 2d, један блиско сродан P. s. pv. coryli је патоген овса, а други блиско сродан P. s. pv. aceris/solidagae проузрокује симптоме на доњем делу стабла пшенице. Према сазнањима докторанта, ни ови патовари нису до сада идентификовани као патогени стрних жита у свету. Три соја блиско сродна P. s. pv. coronafaciens/oryzae, и девет сојева блиско сродних P.s. pv. porri/striafaciens проузрокују симптоме на овсу и ражи и класификовани су у филогрупу 4. Ово је први налаз патовара из филогрупе 4 на ражи у Србији, док су на овсу такође први пут у Србији пронађени и патовари P. s. pv. porri и P. s. pv. striafaciens.На основу резултата ових истраживања, познати диверзитет бактерија као патогена стрних жита се проширује на нове патоваре у оквиру P. syringae sensu stricto или збирне врсте P. syringae и на нову врсту (P. viridiflava) у оквиру P. syringae sensu lato или P. syringae комплекс врста.Међу примењеним методама, осим филогенетске анализе, као поуздан критеријум за диференцијацију бактерија патогена стрних жита може се користити само стварање сирингомицина и то у карактеризацији сојева из филогрупе 2b. Постојање фазнe варијацијe фенотипа доводи у питање коришћење LOPAT шеме као традиционалног дијагностичког средства за диференцијацију P. viridiflava до нивоа врсте.Бактериозе стрних жита у Србији су резултат интеракције више различитих врста/популација бактерија P. syringae sensu stricto и P. syringae sensu lato, из чега проистиче потреба за дефинисањем и новог Коховог постулата који то узима у обзир
https://phaidra.unibl.org/detail_object/o:2486
